根据神话，人们相信是潘多拉出于好奇打开了魔盒，释放出人世间所有的邪恶——贪婪、虚无、诽谤、嫉妒、痛苦等等，唯独把希望留在里面；人们相信是神拯救了自己，他们诅咒带给自己痛苦的人，又只把这些事当成责备的笑话，谁也没有想过那悲鸣的日夜背后，真相到底是什么；人们相信只要虔诚地信仰神，就能天下太平，他们忘记了曾经的苦痛……
直到，普罗米修斯死去的那一天……
战争之神阿瑞斯以人类先知枉死为借口，挑起了要颠覆宙斯神权的战争，实际上，谁都能看出阿瑞斯的野心是想将宙斯取而代之。自从第三次圣战结束，为防止天神作乱，神之间已无法杀死彼此。深知此事的阿瑞斯来到人世，他操控战争，控制了大陆上几乎所有的国家，劫持了被称为战斗一族的斯巴达人，挑选出最强的斯巴达战士，将其培养成为最冷酷无情的“战争机器”，他的目的只有一个，攻上奥林匹斯山，借人类之手，杀死宙斯！
对于阿瑞斯的谋反，宙斯早就算计好了。他暗地里干预阿瑞斯的行动，想将阿瑞斯培养的斯巴达人引向自己的阵营，必要时将阿瑞斯抹杀。阿瑞斯作梦也没想到，亲手培养的“战争机器”竟然与宙斯有血缘之亲，更不会想到这将成为日后的祸患……
然而这场纷争并不这么简单……
冥王哈迪斯蓄恨已久，企图趁这个机会逆转他与宙斯之间不平等的地位，他暗中帮助阿瑞斯，并将深渊和地狱的力量借给阿瑞斯对抗神界，又派出大量魔物大肆破坏，企图通过侵占整片大地让宙斯失去人们的信仰，企图用恐惧统治这个世界……
宙斯担心阿瑞斯和哈迪斯的势力越来越大，于是命令海王波塞冬镇守海洋，太阳神阿波罗驻守天空，而自己则率众神位居宇宙洪荒暗中行动，想一举杀绝所有祸患。但海王波塞冬既不满宙斯的随意调遣，也不想向兄长哈迪斯剑拔弩张，于是他占据海洋独立开来，竖起绝对防线，妄想在这场战争中置身事外，却不知这正正给敌人有了可乘之机。
可谁也没想到，螳螂捕蝉，黄雀在后。在地狱深渊的深处，没落的泰坦神族领袖——盖亚窥视着这所谓的神族内讧，暗中召集失散的泰坦巨人，想要一把夺回本来就属于他们的神界……
大战一触即发，厄运又一次降临，灾难四起，悲鸣遍野，永无休止的战火与杀戮，恐怖的黑夜席卷了整片大地，青铜时代告终，黑暗世纪降临！
智慧女神雅典娜眼看着世界将遭灭顶之灾，她想起了失落的潘多拉魔盒，想起了封印在盒子里世界最强的力量——希望！她向混乱的尘世发出呼唤，集结世间的英雄，寄望找到这一份力量，去平息这场灾厄！
然而……
隐藏在黑暗的深处，一把被人遗忘的声音发出绝望凄惨的笑声……故事才刚刚开始！
